La borréliose de Lyme est décrite chez le chien depuis 1984, soit moins de 10 ans après l'épisode d'arthrite chronique juvénile décrite chez l'homme dans le Connecticut (USA). Elle se détache de la maladie connue chez l'Homme par une pauvreté des atteintes cliniques, et une conjonction avec des atteintes rénales graves chez certaines races de chien. Le diagnostic se heurte aux mêmes contraintes et incertitudes que pour la borréliose de Lyme de l'homme. Le diagnostic de certitude s'appuie sur l'exclusion des autres causes induisant un tableau clinique voisin et différents arguments dont la sérologie n'est qu'un des paramètres.